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side effect は「副作用」という意味ですが、疲労、痛み、嘔吐、悪寒、脱毛などなど、副作用は薬によってさまざまですから、複数形で使われるのが普通です。effectは通常原因に対する「結果」を意味します。しかし、ここでのeffectは「薬の作用」ということですから、頭痛とか吐き気といった結果を引き起こした薬、つまり「原因」も同時にも注目させます。そういうわけで、なんとなく、このsideはside by side(並んで)のsideに近い意味のような気がします。薬と副作用が並んでいる感じがするからです。”Does this medicine have any side effects?” (この薬は副作用はないのですか) Did you ask your doctor about side effects? (副作用についてお医者さんに訊ねたの？)